Blue Macawsissa on ainutlaatuinen hengitysjärjestelmä, jonka avulla ne voivat poistaa tehokkaasti happea ilmasta minimoiden samalla vesihäviön. Toisin kuin nisäkkäillä, linnuilla on ilmapussijärjestelmä, joka mahdollistaa jatkuvan, yksisuuntaisen ilmavirran keuhkojen läpi. Tämä tarkoittaa, että linnun hengittäessä raitista ilmaa imeytyy takailmapusseihin, kun taas käytetty ilma poistuu samanaikaisesti etuilmapusseista. Kun lintu hengittää ulos, prosessi on päinvastainen, jolloin käytetty ilma poistuu takailmapusseista ja raikas ilma pääsee keuhkoihin. Tämä mahdollistaa happipitoisen ilman jatkuvan virtauksen keuhkojen läpi, jolloin lintu voi ottaa happea tehokkaammin kuin nisäkkäät. Takaosan ilmapussilla on myös rooli lämmönsäätelyssä, koska ne ovat kosketuksissa moniin linnun tärkeimpiin verisuoniin. Kun lintu hengittää, ilmapussit jäähdyttävät verta, kun taas uloshengityksen aikana lämmitetty ilma poistuu nokan kautta, mikä auttaa säätelemään linnun kehon lämpötilaa. Kaiken kaikkiaan sinisten arojen hengitysprosessi on hienosäädetty niiden ympäristön erityisvaatimuksiin, jolloin ne voivat menestyä trooppisen sademetsän usein ankarissa olosuhteissa.